生物反應器是一種用于盛載微生物，讓它們實現自然生化反應過程的容器。其中一個簡單，并且大家熟知的生物反應器是啤酒發酵罐，通過促進其中的微生物成長，導致罐中成分發酵，并產生有用的成品。生物反應器有很多類型，并且用途也各有不同，如加工固體廢物，以及生產醫學藥品等。