酸唾液可以由多種原因導致，并可以分為長期和短期因素。吃某些食物，服用特定類型的藥物和缺乏維生素會造成發臭的酸唾液。牙齦疾病，牙齒感染和其它牙科問題也有可能成為罪魁禍首。很多時候，厭氧細菌集聚在舌后也是一個原因，而且還會因為鼻后滴流，慢性口干或睡覺時流涎而進一步加重。此外，燒心的人往往也會注意到唾液酸，這與酸性和未消化的食物返回口腔有關。

有些時候，唾液酸是一個可以自己消失的問題，不會持續很長時間。吃某類酸性或有強烈氣味的食物會留下酸味。它還有可能是特定藥物的副作用，但在停止服藥后就會自己解決。缺乏B12等特定維生素也會導致唾液酸，但可以通過在飲食中添加保健品加以糾正。

牙齒問題是另一個頻繁造成酸唾液的原因。患牙齦疾病，或牙齦組織發炎和感染的人，容易唾液發酸并散發難聞的氣味。感染膿腫的牙齒也會因為口腔細菌過多而產生酸味。

對大多數人來說，口腔細菌增加是導致唾液發酸的原因。這種情況多數發生在睡覺時分泌唾液太少時，這會在早上引起酸唾液和口臭。鼻竇感染的人往往也會因為舌后粘液額外提供適合細菌生長的蛋白質而造成唾液發酸。慢性口干的人會在口腔內積聚太多細菌，并且還會阻礙味蕾功能，使酸臭味更加明顯。

燒心是另一個常見原因。這是胃酸倒流，以及未消化食物顆粒返回喉嚨和口腔的結果，它們與唾液混合會變成酸味或苦味。